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實(shi)例(li)應(ying)用(yong)-如何計算DNA片(pian)段中的(de)分子數(shu)
更新(xin)時(shi)間:2022-05-18
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實驗室(shi)數(shu)學在生物(wu)學實驗數(shu)據分(fen)析(xi)中壹(yi)直是壹(yi)個令人(ren)頭疼的問(wen)題?在(zai)定(ding)量PCR實驗中,常(chang)常會遇(yu)到(dao)計(ji)算 DNA 片(pian)段中的(de)分子、計(ji)算溶液(ye)的(de)濃度或(huo)計(ji)算連(lian)續(xu)稀(xi)釋等,這樣(yang)的計(ji)算有沒有什麽好的方(fang)法呢(ne)?
當然(ran)有了,在(zai)本文(wen)中,我們(men)將(jiang)教(jiao)妳簡單(dan)的 DNA 樣(yang)本中的(de)分子計(ji)數(shu)法。
——例(li)如(ru),套(tao)入公(gong)式(shi)即(ji)可壹(yi)招輕松(song)拆(chai)解(jie):500 ng 樣(yang)本(ben)中有多(duo)少(shao)個 50 堿基(ji)對 (bp) 片(pian)段的(de)模板 /副本(ben)?這樣(yang)的(de)棘手問題。使(shi)您很(hen)快就會成(cheng)為(wei)實(shi)驗室(shi)中的(de)計算高手(shou)!
壹(yi)、計(ji)算 DNA片(pian)段中分(fen)子數(shu)量的應用
在(zai)進行以(yi)下(xia)類(lei)型的實驗時(shi),通(tong)常需(xu)要DNA分子的計算:
DNA 連(lian)接(jie)。
生化(hua)分析(xi)。
實(shi)時(shi) PCR(絕(jue)對定量)。
測量載體(ti)基(ji)因(yin)組(zu)的(de)數(shu)量。
二、分子數(shu)計算公(gong)式(shi)的(de)原(yuan)理
我們(men)知(zhi)道(dao),單(dan)個 DNA bp 的平均重量為 650 道爾頓(dun)。這也可以(yi)寫為(wei) 650 g/mol(= 摩(mo)爾質(zhi)量)。因(yin)此(ci),任(ren)何雙(shuang)鏈(lian) DNA 片(pian)段的(de)分子(zi)量或(huo)摩(mo)爾質(zhi)量都可以(yi)通(tong)過將其(qi)長(chang)度(du)(以(yi) bp 為單(dan)位)乘以(yi) 650來計算,答(da)案將(jiang)表(biao)示為道(dao)爾頓或(huo) g/mol。
只(zhi)要我們(men)知(zhi)道(dao)序(xu)列長(chang)度(du)(即基(ji)因(yin)組(zu)的(de)長度/大小),此(ci)計(ji)算將(jiang)適用於任(ren)何物(wu)種(zhong)的基(ji)因(yin)組(zu) DNA。
三(san)、實例與(yu)應用(yong):
1.實(shi)例問(wen)題(ti): 5.2-kb 質粒的(de)分(fen)子(zi)量是多(duo)少(shao)?記(ji)住 5.2 kb = 5200 bp
計算: 5200 bp x 650 道(dao)爾頓(dun) = 3,380,000 道(dao)爾頓或(huo) g/mol
現(xian)在(zai)我們(men)知(zhi)道(dao)如(ru)何計算 DNA 模(mo)板的分(fen)子量了。使(shi)用阿伏伽德(de)羅數(shu),即 6.022 x 10 23分(fen)子/摩(mo)爾,可以(yi)使(shi)用以(yi)下(xia)公(gong)式(shi)計(ji)算每(mei)份模(mo)板的分(fen)子數(shu):

2.實例(li)問題:您(nin)有 300 ng 的 5.2-kb 質(zhi)粒。妳的質粒有多(duo)少(shao) 拷貝?
3.實例(li)問題:您(nin)有 50 ng 的 20-bp 引物(wu)。妳的引物(wu)有多(duo)少(shao)份(fen)?

4.實例(li)問題:您(nin)有 150 ng 的 670 bp 純化(hua) PCR 產(chan)物(wu),妳有多(duo)少(shao)份(fen) PCR 產(chan)物(wu)?
註意:此(ci)公(gong)式(shi)基(ji)於您(nin)使(shi)用的(de)是單(dan)壹(yi) DNA 物(wu)種(zhong)的假(jia)設,因(yin)此(ci)在應用於 PCR 產(chan)物(wu)或(huo)質(zhi)粒時(shi),請(qing)確(que)保您只(zhi)有 1 個條帶或(huo)您(nin)有幹凈的(de)質(zhi)粒小量制備(bei)。
所以(yi)實驗中,只(zhi)要知(zhi)道(dao) DNA 片(pian)段的(de)長度(du)和(he)以(yi)納克(ke)為單位的濃度,您就可以(yi)輕松(song)應用該公(gong)式(shi)來獲得(de)任(ren)何類型的 DNA 樣本中的(de)拷貝數(shu)。
四、其(qi)他(ta)分(fen)子量計算常(chang)用的(de)公(gong)式(shi)


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